《学理论》杂志筹划于1958年，1959年2月正式出刊。创刊之初名为《理论学习》，后经时任中共哈尔滨市委书记任仲夷同志提议，正式定名为《学理论》，并由他亲自担任首任总编辑。作为哈尔滨市委主办的党刊，《学理论》杂志在各个历史时期都发挥了重要作用，产生了重大社会影响。成为广大党员干部、群众理论学习、理论教育、理论研究和理论宣传的阵地与平台，对推动理论的普及和提高都起到了积极的促进作用，受到了广泛而热烈的欢迎，被当时的人们誉为小《红旗》。
“文革”期间，《学理论》杂志被迫停刊十年。党的十一届三中全会以来，《学理论》杂志肩负着新的历史使命展现于世人面前。在揭批“四人帮”反革命集团罪行、拨乱反正、真理标准大讨论、坚持解放思想、实事求是的思想路线和坚持以经济建设为中心、推进社会主义现代化建设中，都发挥了重要舆论阵地作用，为中国特色社会主义理论体系建设做出了应有贡献。
改革开放初期，《学理论》杂志发行量一直保持在20万份左右，处于全国同类期刊的上游。 20世纪90年代以来，面对期刊市场的激烈竞争和环境变化，《学理论》杂志也受到了市场的强烈冲击和考验。2004年按照国家新闻出版总署的要求，经中共哈尔滨市委决定，将《学理论》杂志整体划转哈尔滨日报集团，不再作为市委党刊。2005年至2007年《学理论》杂志在经营过程中再度停刊。2008年经中共哈尔滨市委决定，将《学理论》杂志再度复刊，并决定由哈报集团划转哈尔滨市社会科学院主管、主办。
《学理论》杂志复刊以来，始终坚持高举旗帜，坚持正确的办刊方向和宗旨，致力把《学理论》杂志办得更加旗帜鲜明，更富时代性，使之成为理论研究的阵地，学术交流的平台。刊物突出学术性、探索性的特点，反映我国改革开放和社会主义现代化建设中的重大理论问题和现实问题，注重刊载具有学术价值和实际应用价值的学术精品，充分发挥学术研究载体的功能，使杂志真正成为广大党员干部，大专院校专家学者的良师益友。杂志先后被评为黑龙江省优秀期刊（社科类）、黑龙江省社会科学类十佳期刊和全国期刊方阵双效期刊。同时，被《中国学术期刊网络出版总库》及CNKI系列数据库，《中国核心期刊（遴选）数据库》，《中国科技期刊数据库（全文）版》，中国龙源期刊网等国内知名网站收录。《学理论》杂志电子光盘版也被海内外多个国家和地区的4300多个学术研究机构、世界著名大学的图书馆收藏，读者遍布世界各地。
半个多世纪的《学理论》杂志，在前进中发展，在发展中壮大，千锤百炼，更加符合时代发展需要。我们坚信，《学理论》杂志在广大读者、作者及编者们的共同努力下，一定会谱写出新的篇章、铸就新的辉煌。